Панель "Заболевания соединительной ткани"(секвенирование нового поколения (NGS), 491 ген) в Коркмаскале

Синдром Элерса — Данлоса (EDS) — группа наследственных заболеваний, для которых характерна гипермобильность (чрезмерная подвижность) суставов, гиперэластичность кожи, хрупкость тканей (повышенная ранимость, склонность к повреждениям и образованию рубцов). У некоторых болезнь приводит к разрывам кровеносных сосудов и внутренних органов.

• COL5A1, COL5A2, COL1A1 — классический EDS;
• COL3A1 — сосудистый EDS;
• PLOD1, FKBP14 — кифосколиотический EDS;
• COL1A1, COL1A2 — артрохалазический EDS;
• ADAMTS2 — дерматоспараксис EDS;
• CHST14, DSE — мускулоконтрактурный EDS;
• B3GALT6, B4GALT7, SLC39A13 — спондилодиспластический EDS;
• ZNF469, PRDM5 — синдром хрупкой роговицы;
• TNXB — классический-подобный EDS.

Несовершенный остеогенез — генетическое заболевание, при котором кости очень хрупкие и легко ломаются. Это происходит из-за проблем с синтезом коллагена — основного белка костной ткани. Течение заболевания варьируется от лёгкого — с небольшим количеством переломов, до очень тяжёлого — с переломами, которые происходят ещё до рождения ребёнка.

• COL1A1, COL1A2 — гены коллагена I типа;
• CRTAP, FKBP10, PLOD2, SERPINH1 — гены посттрансляционной модификации;
• IFITM5, SP7, BMP1 — гены минерализации/остеобластной дифференцировки;
• SERPINF1, MBTPS2 — гены регуляции костного гомеостаза.

Синдром Марфана — генетическое заболевание, которое поражает сердце, кровеносные сосуды, глаза, скелет. Характерные признаки болезни: чрезмерно высокий рост, длинные ноги, руки, пальцы, проблемы со зрением и сердцем.

Синдром Лойса — Дитца — генетическое заболевание, сходное с синдромом Марфана, но зачастую протекающее более агрессивно. Характерные признаки: широко расставленные глаза, расщепление нёба или язычка, аневризмы аорты, скелетные аномалии.

• FBN1, FBN2 — синдром Марфана;
• SMAD3, TGFB2, TGFBR1, TGFBR2 — синдром Лойса — Дитца;
• SKI — ген синдрома Шпринтцена — Гольдберга.

Остеохондродисплазии — группа генетических заболеваний, вызванных мутациями в генах, которые отвечают за рост и развитие костной и хрящевой ткани. Основной признак болезни — скелетные аномалии, чаще всего карликовость и непропорциональное строение тела.

• COL2A1, COL11A1, COL11A2 — ахондрогенез, синдром Стиклера;
• COL9A1, COL9A2, COL9A3 — множественная эпифизарная дисплазия;
• COMP, MATN3 — псевдоахондроплазия;
• FGFR3 — ахондроплазия, танатофорная дисплазия;
• DYNC2H1, IFT80, IFT172, IFT43, WDR35, WDR34, WDR60, CEP152, CENPJ — цилиопатии;
• TRPV4 — метатропическая дисплазия, болезнь Шейе;
• SLC26A2 — диастрофическая дисплазия;
• COL10A1 — болезнь Шмида;
• SLC35D1 — дезмостеолитическая дисплазия;
• XYLT1 — синдром Де Баре;
• SOX9 — кампомелическая дисплазия;
• RUNX2 — ключично-черепная дисплазия;
• PCNT — микроцефалическая остеодисплазия;
• POC1A — синдром SOFT;
• OBSL1, CCDC8 — синдром 3M;
• EVC, EVC2 — синдром Эллиса-ван Кревельда;
• RMRP — хрящевой гипотрихоз;
• FLNB — синдром Ларсена, ателостеогенез.

Буллёзный эпидермолиз — группа наследственных заболеваний, для которых характерно образование на коже пузырей даже при незначительном трении или травме. Течение болезней варьируется от лёгкого, с пузырями только на ладонях и стопах, до тяжёлого, с поражением кожи и слизистых оболочек по всему телу.

Кератодермии — заболевания, для которых характерно утолщение рогового слоя кожи на ладонях и подошвах. В тяжёлых случаях возникают глубокие трещины на коже, которые не позволяют нормально ходить и выполнять даже самые простые действия руками.

• KRT5, KRT14, PLEC, EXPH5, TGM5, KRT1, KRT2, KRT9 — простой буллёзный эпидермолиз;
• LAMA3, LAMB3, LAMC2, COL17A1 — пограничный буллёзный эпидермолиз;
• COL7A1 — дистрофический буллёзный эпидермолиз;
• FERMT1 — синдром Киндлера;
• GJB2, GJB3, GJB4, GJB6, TGM1, CSTA, DSG1, DSC3, DSG4, JUP, DSP, LIPH, ST14, PKP1 — кератодермии;
• KRT6A, KRT6C — пахионихия;
• KRT1, KRT10 — ихтиоз + кератодермия.

Метаболические нарушения возникают из-за мутаций в генах, которые отвечают за работу белков или ферментов. В результате накапливаются токсины или, наоборот, возникает дефицит питательных веществ, которые нужны клеткам для нормальной работы.

Нередко метаболические нарушения затрагивают и соединительную ткань, что приводит к скелетным деформациям, повреждению суставов, дряблости или аномальной эластичности кожи, проблемам со зрением, сердцем, кровеносными сосудами.

• IDS, IDUA, GALNS, GLB1, ARSB, GNS, HGSNAT, NAGLU, SGSH — мукополисахаридозы;
• GNPTAB, GNPTG — муколипидозы;
• ABCC6 — псевдоксантома эластическая;
• ATP7A — болезнь Менкеса;
• ALPL — гипофосфатазия;
• DHCR7 — синдром Смита — Лемли — Опица;
• EBP — хондродисплазия пунктата, Х-сцепленная доминантная форма;
• CYP27B1 — дефицит 1-альфа-гидроксилазы витамина D;
• CYP2R1 — дефицит 25-гидроксилазы витамина D;
• CYP4F22 — ихтиоз, ламеллярный;
• GNPAT — ризомелическая хондродисплазия пунктата тип 1;
• SUMF1 — множественный дефицит сульфатаз;
• ARSE — Х-сцепленная хондродисплазия пунктата 1 типа;
• HFE, HFE2, HAMP, TFR2 — гемохроматоз.

Синдромы старения, или прогерии, — редкие генетические заболевания, при которых дети стремительно стареют. Уже в раннем возрасте у них начинают выпадать волосы, истончается кожа, возникают проблемы с костями и суставами, развиваются сердечно-сосудистые заболевания.

Нарушение ДНК-репарации — состояние, при котором ошибки в генетическом материале не исправляются, а накапливаются в организме. Это существенно повышает риск развития рака и может привести к преждевременному старению.

• LMNA, ZMPSTE24 — прогерия;
• WRN — синдром Вернера;
• ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, XPA, XPC, POLH — ксеродерма пигментная;
• ERCC6, ERCC8 — синдром Коккейна;
• BLM — синдром Блума;
• RECQL4 — синдром Ротмунда — Томсона;
• ATM — атаксия-телеангиэктазия;
• DKC1 — дискератоз врождённый;
• CTC1 — синдром Коутса плюс;
• POLE, POLD1 — полимеразные синдромы.

Васкулопатии — заболевания, при которых кровеносные сосуды повреждаются, их структура и функции нарушаются.

Ангиодисплазии — аномальные расширения и деформации кровеносных сосудов.

• ACVRL1, ENG, SMAD4 — наследственная геморрагическая телеангиэктазия;
• KRIT1, CCM2, PDCD10 — церебральные кавернозные мальформации;
• RASA1 — синдром капиллярных мальформаций-артериовенозных мальформаций;
• NOTCH1 — синдром Адамса — Оливера;
• FOXC2, GJC2 — первичные лимфедемы;
• PIK3CA — синдромы избыточного роста, связанные с PIK3CA.

В эту группу входят гены, связанные с редкими врождёнными пороками развития, такими как синдром Таунса — Брокса, Окихиро, Симпсона — Голаби — Бемеля и другими.

• LMX1B, HOXD13, ROR2, ALX4 — гены, преимущественно ассоциированные с костно-скелетными синдромами/дисплазиями;
• TWIST1, TWIST2, EFNB1, PORCN, ALX4, TP63 — гены, ассоциированные с синдромами поражения челюстно-лицевой области и/или конечностей;
• TRPS1, SALL1, SALL4, NSDHL, ANTXR1, GPC6, FILIP1L, FREM1, GRHL2 — гены, связанные с синдромами множественных врождённых аномалий/синдромами задержки развития;
• ALPL — гипофосфатазия.

В эту группу входят гены, которые прямо или косвенно участвуют в развитии и функционировании соединительной ткани.

• COL17A1, COL4A1, ELN, EFEMP2, FBLN1, FBLN5, HSPG2, LTBP4, MGP, PLOD3, WISP3 — гены, прямо участвующие в синтезе коллагена и определяющие структуру компонентов внеклеточного матрикса;
• CHST3, PAPSS2, SLC26A2 — гены, участвующие в метаболизме сульфатированных гликозаминогликанов (GAG), компонентов хряща и других тканей;
• ACVR1, ACVR2B, BMP2, BMPR1B, BMPER, GDF1, GDF3, GDF5, GDF6, NODAL, NOG, SMAD2, TGFB1, TGFB3 — гены, участвующие в регуляции TGF-beta и BMP сигнальных путей;
• ADAMTS10, ADAMTSL2, MMP1, MMP13, MMP9 — гены, кодирующие матриксные металлопротеиназы (MMP) и их регуляторы;
• ALDH18A1, BHLHA9, DMP1, FGFR1, IHH, LRP5, MEOX1, MSX1, MSX2, PTH1R, PTHLH, SOST — гены, участвующие в развитии костей и хрящей;
• ACTA2, CREBBP, EP300, FLNA, MED12, NF1, PIEZO2, TBX3, TBX5, TP63 — гены, связанные с синдромами дизморфогенеза и скелетными дисплазиями;
• CDKN1C, CUL7, PTEN, TSC1, TSC2 — гены, участвующие в делении клеток и регуляции клеточного цикла;
• CBS, PYCR1 — гены, связанные с метаболическими нарушениями, влияющими на соединительную ткань;
• SLC2A10, SLC39A13 — гены, участвующие в транспорте веществ, необходимых для построения соединительной ткани; A2ML1, AAGAB, ABCA12, ABCB6, ABCC9, ABHD5, ACP5, ADAM10, ADAR, AGPS, AKT1, AKT3, ALDH3A2, ALMS1, ALOX12B, ALOXE3, AMER1, ANKH, ANO5, AP1S1, AP3B1, APCDD1, AQP5, ATR, AXIN2, BANF1, BCS1L, BLOC1S3, BLOC1S6, BRAF, C10orf11, CA2, CARD14, CASR, CBL, CCBE1, CDC45, CDC6, CDH3, CDT1, CEP63, CLCN5, CLCN7, CLDN1, CRELD1, CTC1, CYLD, CYP26C1, DDB2, DDR2, DHCR24, DLL3, DLX3, DNA2, DOK7, DONSON, DST, DTNBP1, DYM, ECEL1, EDA, EDAR, EDARADD, EDN3, EDNRB, EIF2AK3, ELOVL4, ENPP1, EPG5, ERF, ESCO2, FAM111A, FAM20C, FAM58A, FAT4, FERMT1, FGF10, FGF23, FGF9, FLCN, FLG, FLT4, FOXN1, GATA2, GINS1, GJA1, GLI3, GMNN, GORAB, GPR143, GSC, GTF2H5, HOXA11, HOXC13, HPS1, HPS3, HPS4, HPS5, HPS6, HPGD, HR, HRAS, IFIH1, IFT122, IKBKG, IL11RA, IMPAD1, ITGA3, ITGA6, ITGB4, JUP, KIF11, KIF22, KIT, KITLG, KRAS, LARP7, LBR, LEFTY2, LEMD3, LIFR, LIPN, LMBR1, LOR, LPAR6, LRP4, LYST, MAP2K1, MAP2K2, MC1R, MCM5, MITF, MLH1, MLPH, MPLKIP, MSH2, MSH6, MTAP, MYBPC1, MYH11, MYH3, MYH8, MYLK, MYO5A, NEK1, NF2, NFKBIA, NHP2, NIN, NIPAL4, NKX2-5, NKX3-2, NOP10, NPR2, NRAS, OCA2, OFD1, ORC1, ORC4, ORC6, OSTM1, PAX3, PCYT1A, PDE4D, PDGFRB, PEX7, PHEX, PHYH, PIGL, PIK3R2, PKD1, PKD2, PLEKHM1, PMS2, PNPLA1, POP1, POR, PPIB, PRKAR1A, PRKG1, PTCH1, PTDSS1, PTHLH, PTPN11, PVRL1, PVRL4, RAB23, RAB27A, RAF1, RAPSN, RBBP8, RBM28, RHBDF2, RIN2, RIT1, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RTEL1, SAMHD1, SBDS, SDHB, SDHD, SERPING1, SF3B4, SH3PXD2B, SHOC2, SLC27A4, SLC34A1, SLC34A3, SLC40A1, SLC45A2, SLC9A3R1, SLCO2A1, SLURP1, SNAI2, SNAP29, SNRPE, SNX10, SOS1, SOX10, SOX18, SPINK5, SPRED1, STAMBP, STK11, STS, TALDO1, TAT, TBCE, TBX15, TCF12, TCIRG1, TCTN3, TERC, TERT, TINF2, TNFRSF11A, TNFRSF11B, TNFSF11, TNNI2, TNNT3, TPM2, TRAPPC2, TREX1, TRIP11, TRPV3, TTC21B, TYR, TYROBP, TYRP1, UBR1, USB1, VDR, VPS33B, WNT10A, WNT10B, WNT5A, WNT7A, WRAP53, ZIC3 — другие гены, которые могут быть связаны с заболеваниями соединительной ткани