Анализ микробиоты по Осипову (биотоп "Тонкая кишка") в Мураши
Анализ поможет определить, какие микроорганизмы населяют тонкий кишечник человека. В основе исследования — определение в крови химических веществ, которые выделяют бактерии (в том числе анаэробные), грибы и некоторые вирусы.
Синонимы и связанные понятия
Microbiome test, анализ на микробиоту кишечника
Приём биоматериала
- Можно сдать в отделении Гемотест
- Правила подготовки к анализу
Зачем сдавать этот анализ?
Показания к исследованию микробиоты кишечника методом ГХ-МС по Осипову:
- подозрение на нарушение микрофлоры тонкой кишки;
- частые запоры или диарея;
- синдром раздражённого кишечника — нарушение функции кишечника;
- язвенный колит;
- болезнь Крона — хроническое воспалительное заболевание кишечника;
- приём антибиотиков;
- нарушение стула после COVID-19.
Подробное описание исследования
Микробиота и её функции
Микробиота — совокупность микроорганизмов, которые населяют кожу и слизистые оболочки желудочно-кишечного тракта, полостей носа и рта, органов мочеполовой системы.
Самой многочисленной считается микробиота кишечника — на неё приходится около 60% всех бактерий, колонизирующих тело человека.
Полезные (комменсальные) бактерии помогают иммунной системе справиться с болезнетворными микроорганизмами, в некоторых случаях подавляют воспалительные и аллергические реакции.
Основные виды полезных бактерий-комменсалов:
- лактобактерии,
- бифидобактерии,
- кишечные палочки (типичные).
Условно патогенные (оппортунистические) бактерии обычно безвредны для здоровых людей и в небольшом количестве присутствуют в организме для поддержания разнообразия микрофлоры. Но если баланс кишечной микробиоты нарушается, например, из-за сбоя в работе иммунной системы, то такие бактерии быстро размножаются и могут причинить вред.
Виды условно патогенных микроорганизмов:
- энтеробактерии (эшерихии, бактерии рода протей, клебсиеллы): могут вызвать инфекционные заболевания желудочно-кишечного тракта, лёгких, мочеполовой системы, печени, желчевыводящих путей;
- неферментирующие грамотрицательные бактерии (псевдомонады, нейссерии, легионеллы): вызывают заболевания мочевыводящих путей и органов репродуктивной системы, кишечника, а также пневмонии, менингиты, отиты;
- грамположительные кокки (стафилококки, стрептококки, энтерококки) и анаэробные бактерии: возбудители гнойно-воспалительных заболеваний;
- грибы: провоцируют инфекции органов желудочно-кишечного тракта.
Одна из основных функций микробиоты — синтез короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК), основного источника энергии для клеток слизистой оболочки кишечника. Также КЦЖК защищают организм от патогенов и токсинов, обладают противоопухолевым и противовоспалительным эффектом, стимулируют развитие нормальной микрофлоры, регулируют кислотно-щелочной баланс и поддерживают усвоение калия, магния, хлора, натрия и воды.
Другие функции микробиоты кишечника:
- выведение из организма отработанных биологически активных веществ, в том числе ферментов;
- выработка гормонов, мочевой кислоты, незаменимых аминокислот и нейропептидов — биологически активных соединений, которые участвуют в обмене веществ.
Изучение микробиоты продолжается. Появились исследования, в которых доказана взаимосвязь между нарушением микрофлоры кишечника и сахарным диабетом второго типа, ожирением, сердечно-сосудистыми заболеваниями.
Есть данные о взаимодействии кишечной микробиоты и нервной системы: микробиота производит нейроактивные молекулы — ацетилхолин, серотонин, дофамин — главные медиаторы сигналов в центральной нервной системе. Если состав микробиоты нарушается, то заболевания центральной нервной системы могут прогрессировать.
Нарушение микробиоты при постковидном синдроме
В желудке, двенадцатиперстной и прямой кишке есть белки-рецепторы к вирусу SARS-CoV-2. Вирус связывается с рецепторами и проникает в клетки. При этом в слизистой оболочке кишечника может развиться воспаление, на фоне которого часто возникают гастроэнтерологические симптомы: диарея, синдром мальабсорбции — нарушение усвоения питательных веществ, дисбактериоз — состояние, при котором страдает микрофлора кишечника.
Нарушение микробиоты сохраняется и в постковидном периоде. Примерно у 6% переболевших дисбактериоз сопровождается расстройствами дефекации.
Диагностика состояния микробиоты: газовая хроматография — масс-спектрометрия
Для оценки состояния микробиоты используют различные лабораторные методы. Один из них — газовая хроматография — масс-спектрометрия (ГХ-МС).
Газовая хроматография — масс-спектрометрия — аналитический метод, разработанный российскими учёными во главе с профессором микробиологии Георгием Андреевичем Осиповым. В основе метода лежит определение микроорганизмов по так называемым микробным маркерам — жирным кислотам, которые производятся бактериями в процессе жизнедеятельности.
У каждого вида бактерий — свой уникальный набор жирных кислот, который можно идентифицировать с помощью газовой хроматографии — масс-спектрометрии. По этому набору можно судить о составе микробиоты — просто по анализу крови и без предварительного культивирования микроорганизмов, в отличие от метода микробиологической диагностики.
Основные преимущества газовой хроматографии — масс-спектрометрии:
- универсальность: метод подходит для любого биоматериала;
- высокая чувствительность и достоверность;
- одновременное определение более 50 видов бактерий, грибков и некоторых вирусов;
- возможность выявить анаэробы — бактерии, которые живут и размножаются в бескислородной среде;
- отсутствие противопоказаний к проведению исследования.
Особенности и преимущества методики
Газовый хроматограф с масс-спектрометрическим детектором, производитель «Agilent Technologies» (США).
Источники
- Гуров М. М., Романова Т. А., Новикова В. П. и др. Роль новых методов диагностики в оценке состояния кишечной микробиоты у детей с хроническим гастродуоденитом // Вестник Челябинского государственного университета, 2014. № 13(342). С. 42–49.
- Chang Y., Chen Y., Zhou Q., et al. Short-chain fatty acids accompanying changes in the gut microbiome contribute to the development of hypertension in patients with preeclampsia // Clin Sci (Lond), 2020. Vol. 134(2). P. 289–302. doi:10.1042/CS20191253
- Aragonès G., Aguilar C., Colom-Pellicer M. Circulating microbiota-derived metabolites: a liquid biopsy // Int J Obes (Lond), 2020. Vol. 44. P. 875–885. doi:10.1038/s41366-019-0430-0
Технология выполнения
Биоматериал
Вен. кровь
Метод исследования
Газовая хроматография масс-спектрометрия (ГХ-МС) микробных маркеров
Приказ МЗ РФ № 804н
A26.30.005
Что еще назначают с этим исследованием
Подготовка к исследованию
- За 3–4 часа до взятия крови не следует есть, а также пить соки, молоко или другие напитки. Можно пить негазированную воду. Накануне исследования лучше поужинать лёгкой, нежирной пищей.
- За 2 недели до анализа по согласованию с врачом рекомендуется прекратить приём антибиотиков, пробиотиков, метабиотиков и антидепрессантов.
Правила взятия крови у детей:
Если требуется сдать анализы крови на другие показатели в один день с исследованием микробиоты, следует придерживаться правил подготовки к этим анализам.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Интерпретация результата
По результатам исследования врач определит причины дисбактериоза, диагностирует заболевания, связанные с нарушением состава микрофлоры кишечника и назначит лечение и/или специальную диету для нормализации микрофлоры.
Интерпретация полученных результатов должна проводиться только врачом с учетом жалоб, осмотра, данных других исследований.
Единица измерения
Кл/г
Референсные значения
*Klebsiella, Enterobacter, Hafnia, Serratia, Proteus, Morganella, Providecia, Citrobacter и другие представители.
**Pseudomonas, Acinetobacter и другие.