Анализ микробиоты по Осипову (биотоп просветная микробиота "Толстая кишка") в Мытищах
Исследование позволяет определить, какие микроорганизмы присутствуют в составе микрофлоры толстой кишки. Анализ используется для диагностики кишечных инфекций, дисбиозов и воспалительных процессов в желудочно-кишечном тракте.
Синонимы и связанные понятия
Microbiome test, анализ на микробиоту кишечника
Приём биоматериала
- Можно сдать в отделении Гемотест
- Правила подготовки к анализу
Зачем сдавать этот анализ?
Основные показания к назначению:
- диагностика нарушения состава микрофлоры толстой кишки при заболеваниях, которые сопровождаются болями в животе, изменениями стула, избыточным газообразованием;
- выявление нарушений кишечной микробиоты на фоне приёма антибиотиков.
Подробное описание исследования
Микробиота и её функции
Микробиота — совокупность микроорганизмов, которые населяют кожу и слизистые оболочки желудочно-кишечного тракта, полостей носа и рта, органов мочеполовой системы.
Самой многочисленной считается микробиота кишечника — на неё приходится около 60% всех бактерий, колонизирующих тело человека. В норме в кишечнике обитают полезные (комменсальные) и условно-патогенные (оппортунистические) бактерии.
Полезные (комменсальные) бактерии помогают иммунной системе справиться с болезнетворными микроорганизмами, в некоторых случаях подавляют воспалительные и аллергические реакции.
Основные виды полезных бактерий-комменсалов:
- лактобактерии,
- бифидобактерии,
- кишечные палочки (типичные).
Условно-патогенные (оппортунистические) бактерии обычно безвредны для здоровых людей и в небольшом количестве присутствуют в организме для поддержания разнообразия микрофлоры. Но если баланс кишечной микробиоты нарушается, например из-за сбоя в работе иммунной системы, то такие бактерии быстро размножаются и могут причинить вред.
Виды условно-патогенных микроорганизмов:
- энтеробактерии (эшерихии, бактерии рода протей, клебсиеллы): могут вызвать инфекционные заболевания желудочно-кишечного тракта, лёгких, мочеполовой системы, печени, желчевыводящих путей;
- неферментирующие грамотрицательные бактерии (псевдомонады, нейссерии, легионеллы): вызывают заболевания мочевыводящих путей и органов репродуктивной системы, кишечника, а также пневмонии, менингиты, отиты;
- стафилококки и анаэробные бактерии: возбудители гнойно-воспалительных заболеваний;
- грибы: провоцируют инфекции органов желудочно-кишечного тракта.
Одна из основных функций микробиоты — синтез короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК), основного источника энергии для клеток слизистой оболочки кишечника. Также КЦЖК защищают организм от патогенов и токсинов, обладают противоопухолевым и противовоспалительным эффектом, стимулируют развитие нормальной микрофлоры, регулируют кислотно-щелочной баланс и поддерживают усвоение калия, магния, хлора, натрия и воды.
Другие функции микробиоты кишечника:
- выведение из организма отработанных биологически активных веществ, в том числе ферментов;
- выработка гормонов, мочевой кислоты, незаменимых аминокислот и нейропептидов — биологически активных соединений, которые участвуют в обмене веществ.
Изучение микробиоты продолжается. Появились исследования, в которых доказана взаимосвязь между нарушением микрофлоры кишечника и сахарным диабетом второго типа, ожирением, сердечно-сосудистыми заболеваниями.
Есть данные о взаимодействии кишечной микробиоты и нервной системы: микробиота производит нейроактивные молекулы (ацетилхолин, серотонин, дофамин) — главные медиаторы сигналов в центральной нервной системе. Если состав микробиоты нарушается, то заболевания центральной нервной системы могут прогрессировать.
Источники
- Осипов Г. А., Родионов Г. Г. Микроэкология человека в норме и патологии по данным масс-спектрометрии микробных маркеров // Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях, 2013. № 2. С. 43–53.
- Dabur R., Shirolkar A., Mishra V., et al. Non-invasive Qualitative Urinary Metabolomic Profiling Discriminates Gut Microbiota Derived Metabolites in the Moderate and Chronic Alcoholic Cohorts // Curr Pharm Biotechnol, 2017. Vol. 18(14). P. 1175–1189. doi:10.2174/1389201019666180308093207
Особенности и преимущества методики
Для оценки состояния микробиоты используют различные лабораторные методы. Один из них — газовая хроматография — масс-спектрометрия (ГХ-МС). Это аналитический метод, разработанный российскими учёными во главе с профессором микробиологии Георгием Андреевичем Осиповым.
В основе метода лежит определение микроорганизмов по так называемым микробным маркерам — жирным кислотам, которые производятся бактериями в процессе жизнедеятельности.
У каждого вида бактерий свой уникальный набор жирных кислот, который можно идентифицировать с помощью газовой хроматографии — масс-спектрометрии. По этому набору можно судить о составе микробиоты — просто по анализу крови и без предварительного культивирования микроорганизмов, в отличие от метода микробиологической диагностики.
Основные преимущества газовой хроматографии — масс-спектрометрии:
- универсальность: метод подходит для любого биоматериала;
- высокая чувствительность и специфичность;
- одновременное определение более 50 видов бактерий, грибков и некоторых вирусов;
- возможность выявлять анаэробы — бактерии, которые живут и размножаются в бескислородной среде;
- отсутствие противопоказаний к проведению исследования.
Технология выполнения
Биоматериал
Кал
Метод исследования
Газовая хроматография с масс-спектрометрией
Приказ МЗ РФ № 804н
A26.30.005
Что еще назначают с этим исследованием
Подготовка к исследованию
Рекомендуется прекратить приём антибактериальных препаратов за 14 дней до взятия биоматериала.
За 72 часа до исследования откажитесь от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, прекратите приём препаратов, влияющих на работу кишечника и окраску кала.
Соберите образец кала после естественного опорожнения кишечника без применения клизм или слабительных средств.
Позаботьтесь о том, чтобы в биоматериал не попали посторонние примеси: вода, моча, выделения половых органов, дезинфицирующие средства и химические вещества, содержащиеся в подгузниках:
- перед дефекацией вымойте и высушите промежность;
- соберите кал с чистой и не впитывающей влагу поверхности: это может быть чистый пакет из полиэтилена, клеёнка, чистое судно или горшок.
Собирать кал из унитаза, пелёнок или подгузников нельзя!
Поместите 1–2 чайные ложки биоматериала в герметичный контейнер. Если нужно выполнить несколько анализов, подготовьте для каждого исследования отдельную порцию биоматериала в отдельном контейнере.
Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после сбора. Контейнер можно поместить в термос с кубиком льда или в пакет с хладоэлементами.
Если отслеживаете показатели в динамике, сдавайте каждый анализ при одинаковых условиях: в том же лабораторном отделении, тем же методом.
Противопоказания и ограничения
Абсолютных противопоказаний нет.
Интерпретация результата
Результаты одного исследования не могут служить достаточным основанием для постановки диагноза или назначения лечения. Решение об этом должен принимать врач на основании всех имеющихся у него данных.