Анализ микробиоты по Осипову (биотоп просветная микробиота "Толстая кишка") в Нижнем Новгороде

Зачем сдавать этот анализ?

Основные показания к назначению:

• диагностика нарушения состава микрофлоры толстой кишки при заболеваниях, которые сопровождаются болями в животе, изменениями стула, избыточным газообразованием;
• выявление нарушений кишечной микробиоты на фоне приёма антибиотиков.

Подробное описание исследования

Микробиота и её функции

Микробиота — совокупность микроорганизмов, которые населяют кожу и слизистые оболочки желудочно-кишечного тракта, полостей носа и рта, органов мочеполовой системы.

Самой многочисленной считается микробиота кишечника — на неё приходится около 60% всех бактерий, колонизирующих тело человека. В норме в кишечнике обитают полезные (комменсальные) и условно-патогенные (оппортунистические) бактерии.

Полезные (комменсальные) бактерии помогают иммунной системе справиться с болезнетворными микроорганизмами, в некоторых случаях подавляют воспалительные и аллергические реакции.

Основные виды полезных бактерий-комменсалов:

• лактобактерии,
• бифидобактерии,
• кишечные палочки (типичные).

Условно-патогенные (оппортунистические) бактерии обычно безвредны для здоровых людей и в небольшом количестве присутствуют в организме для поддержания разнообразия микрофлоры. Но если баланс кишечной микробиоты нарушается, например из-за сбоя в работе иммунной системы, то такие бактерии быстро размножаются и могут причинить вред.

Виды условно-патогенных микроорганизмов:

• энтеробактерии (эшерихии, бактерии рода протей, клебсиеллы): могут вызвать инфекционные заболевания желудочно-кишечного тракта, лёгких, мочеполовой системы, печени, желчевыводящих путей;
• неферментирующие грамотрицательные бактерии (псевдомонады, нейссерии, легионеллы): вызывают заболевания мочевыводящих путей и органов репродуктивной системы, кишечника, а также пневмонии, менингиты, отиты;
• стафилококки и анаэробные бактерии: возбудители гнойно-воспалительных заболеваний;
• грибы: провоцируют инфекции органов желудочно-кишечного тракта.

Одна из основных функций микробиоты — синтез короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК), основного источника энергии для клеток слизистой оболочки кишечника. Также КЦЖК защищают организм от патогенов и токсинов, обладают противоопухолевым и противовоспалительным эффектом, стимулируют развитие нормальной микрофлоры, регулируют кислотно-щелочной баланс и поддерживают усвоение калия, магния, хлора, натрия и воды.

Другие функции микробиоты кишечника:

• выведение из организма отработанных биологически активных веществ, в том числе ферментов;
• выработка гормонов, мочевой кислоты, незаменимых аминокислот и нейропептидов — биологически активных соединений, которые участвуют в обмене веществ.

Изучение микробиоты продолжается. Появились исследования, в которых доказана взаимосвязь между нарушением микрофлоры кишечника и сахарным диабетом второго типа, ожирением, сердечно-сосудистыми заболеваниями.

Есть данные о взаимодействии кишечной микробиоты и нервной системы: микробиота производит нейроактивные молекулы (ацетилхолин, серотонин, дофамин) — главные медиаторы сигналов в центральной нервной системе. Если состав микробиоты нарушается, то заболевания центральной нервной системы могут прогрессировать.

Источники

1. Осипов Г. А., Родионов Г. Г. Микроэкология человека в норме и патологии по данным масс-спектрометрии микробных маркеров // Медико-биологические и социально-психологические проблемы безопасности в чрезвычайных ситуациях, 2013. № 2. С. 43–53.
2. Dabur R., Shirolkar A., Mishra V., et al. Non-invasive Qualitative Urinary Metabolomic Profiling Discriminates Gut Microbiota Derived Metabolites in the Moderate and Chronic Alcoholic Cohorts // Curr Pharm Biotechnol, 2017. Vol. 18(14). P. 1175–1189. doi:10.2174/1389201019666180308093207

Особенности и преимущества методики

Для оценки состояния микробиоты используют различные лабораторные методы. Один из них — газовая хроматография — масс-спектрометрия (ГХ-МС). Это аналитический метод, разработанный российскими учёными во главе с профессором микробиологии Георгием Андреевичем Осиповым.

В основе метода лежит определение микроорганизмов по так называемым микробным маркерам — жирным кислотам, которые производятся бактериями в процессе жизнедеятельности.

У каждого вида бактерий свой уникальный набор жирных кислот, который можно идентифицировать с помощью газовой хроматографии — масс-спектрометрии. По этому набору можно судить о составе микробиоты — просто по анализу крови и без предварительного культивирования микроорганизмов, в отличие от метода микробиологической диагностики.

Основные преимущества газовой хроматографии — масс-спектрометрии:

• универсальность: метод подходит для любого биоматериала;
• высокая чувствительность и специфичность;
• одновременное определение более 50 видов бактерий, грибков и некоторых вирусов;
• возможность выявлять анаэробы — бактерии, которые живут и размножаются в бескислородной среде;
• отсутствие противопоказаний к проведению исследования.

Что еще назначают с этим исследованием