Определение мутаций в генах репарации ДНК (HRR) методом NGS: Solo ABC (кровь) в Северск

Зачем сдавать этот анализ?

Как правило, анализ сдают люди, которые хотят быть максимально осведомлены о наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям. Результаты ДНК-теста помогают внести в жизнь изменения, которые способны предотвратить рак, или спланировать объём и частоту профилактических обследований, которые помогут выявить опухоль на ранней стадии, когда шансы на успех терапии особенно высоки.

Также исследование показано:

• людям с онкологическими заболеваниями у родственников (рак молочной железы или рак яичников, меланома, саркома, рак эндометрия, фолликулярный рак щитовидной железы, почечноклеточный рак, рак предстательной железы, рак поджелудочной железы), особенно в возрасте до 50 лет;
• людям, у которых было диагностировано онкологическое заболевание, особенно в молодом возрасте (до 45–50 лет);
• пациентам с первично-множественными злокачественными опухолями (двусторонний рак молочных желёз, сочетание рака молочной железы и рака яичника, местнораспространённый или метастатический рак предстательной железы);
• людям, у которых в семье была обнаружена опасная мутация в генах HRR, связанная с наследственными формами рака;
• представителям этнических групп, которые подвержены высокому риску наследственных форм рака, к ним относятся евреи ашкенази и выходцы из Ирака.

Людям с онкологическим диагнозом генетическое исследование методом NGS помогает определить подтип опухоли и подобрать прицельную терапию с учётом специфики новообразования. Тест также используется, чтобы контролировать эффективность лечения.

Подробное описание исследования

Гены репарации ДНК

Практически в каждой клетке организма содержится ДНК — молекула, в которой записана вся наследственная информация человека: как будут работать органы, каким будет цвет глаз и тембр голоса, к каким болезням будет предрасположенность.

Когда клетки делятся, их ДНК копируется. Так передаётся генетическая информация. Процесс синтеза новой ДНК при делении клеток называют репликацией.

В норме при репликации регулярно происходят ошибки. Чтобы их исправлять, в организме есть специальная система репарации («починки»). За её работу отвечают гены репарации ДНК, или гены HRR (homologous recombination repair).

Мутации в генах HRR и рак

Иногда в работу генов репарации ДНК закрадываются ошибки — мутации. Они могут как полностью отключить систему репарации, так и частично нарушить её. В результате этого в процессе передачи генетической информации новым клеткам формируются дефектные молекулы ДНК. Чем их больше, тем выше вероятность злокачественного перерождения клеток и риск развития онкологических заболеваний.

Мутации в генах HRR могут быть наследственными, они передаются от родителей и присутствуют во всех клетках с рождения, и соматическими — возникают в отдельных клетках в течение жизни.

Мутации, полученные от родителей, представляют особую опасность, потому что обусловливают наследственные опухолевые синдромы. В этом случае человек имеет высокий риск развития рака в молодом возрасте и предрасположен к формированию множественных опухолей.

На долю наследственных опухолевых синдромов приходится около 5–10% всех случаев рака. Как правило, такие онкологические заболевания развиваются стремительно и тяжелее поддаются лечению.

Генов HRR много, связь с наследственными онкологическими синдромами подтверждена для 15 из них: BRCA1/2, BARD1, CHEK1/2, PALB2, ATM, CDK12, RAD51C, BRIP1, PPP2R2A, RAD51D, FANCL, RAD51B, RAD54L.

Один из распространённых наследственных опухолевых синдромов — синдром наследственного рака молочной железы и яичников (hereditary breast and ovarian cancer syndrome). Он связан с дефектами в генах BRCA1 и BRCA2 и вызывает около 5–15% случаев рака молочной железы и до 15–20% случаев рака яичников. Также эти и другие мутации в генах HRR обусловливают высокий риск рака прямой кишки, желудка, кожи, предстательной и поджелудочной железы.

Особенности и преимущества методики

Исследование мутаций в генах HRR производится по технологии NGS (next generation sequencing). Метод NGS позволяет одновременно расшифровать тысячи фрагментов ДНК. Благодаря ему можно определить большинство генетических мутаций и судить о риске развития онкологических заболеваний.

Классические методы исследования, такие как ПЦР, дают возможность изучать отдельные точечные мутации в конкретном гене. Стандартный ДНК-тест по методу ПЦР учитывает до 8 значимых точек, в то время как метод NGS позволяет прочитать все кодирующие участки генов HRR и определить более 6 000 патогенных вариантов.

NGS-тест с полным прочтением генов HRR — самый точный способ выявить генетическую предрасположенность к онкологическим заболеваниям, связанным с наследственными синдромами.

В ходе данного исследования определяются только наследственные мутации, которые передаются человеку от родителей. Мутации, возникающие на протяжении жизни (соматические), при проведении анализа крови обнаружить нельзя.

Источники

1. Shao C., Wan J., Lam F. C., et al. A comprehensive literature review and meta-analysis of the prevalence of pan-cancer BRCA mutations, homologous recombination repair gene mutations, and homologous recombination deficiencies // Environ Mol Mutagen. 2022. Vol. 63(6). P. 308–316. doi:10.1002/em.22505
2. Cortesi L., Rugo H. S., Jackisch C. An overview of PARP Inhibitors for the treatment of breast cancer // Target Oncol. 2021. Vol. 16(3). P. 255–282. doi:10.1007/s11523-021-00796-4
3. Johnson N., Li Y. C., Walton Z. E., et al. Compromised CDK1 activity sensitizes BRCA-proficient cancers to PARP inhibition // Nat Med. 2011. Vol. 17(7). Vol. 875–882. doi:10.1038/nm.2377
4. Chen J., Tang Y., Liu H., et al. The mutational pattern of homologous recombination repair genes in urothelial carcinoma and its correlation with immunotherapeutic response // Cancer Med. 2023. Vol. 12(24). P. 22370–22380. doi:10.1002/cam4.6725
5. Schlacher K., Wu H., Jasin M. A distinct replication fork protection pathway connects Fanconi anemia tumor suppressors to RAD51-BRCA1/2 // Cancer Cell. 2012. Vol. 21(3). P. 404–416. doi:10.1016/j.ccr.2012.01.030
6. Ciccia A., Elledge S. J. The DNA damage response: making it safe to play with knives // Mol Cell. 2010. Vol. 40(2). P. 179–204. doi:10.1016/j.molcel.2010.09.019
7. Маилян О. А., Калпинский А. С., Решетов И. В. Клиническое значение мутаций в генах репарации ДНК у больных метастатическим раком предстательной железы // Онкоурология. 2021. Vol. 17(1). P. 82–88. doi:10.17650/1726-9776-2021-17-1-82-88
8. Литвинов С. В. Основные пути репарации двойных разрывов геномной ДНК и взаимодействия между ними // Цитология и генетика. 2014. № 48(3). C. 64–77.

Что еще назначают с этим исследованием