Панель "Задержка развития и аутизм" в Зарайске
Генетическое исследование включает анализ 286 генов, связанных с задержкой психоречевого развития, умственной отсталостью, аутизмом. Результаты анализа помогают разработать персональный план лечения и поддержки детей с такими нарушениями.
Приём биоматериала
- Можно сдать в отделении Гемотест
- Правила подготовки к анализу
Зачем сдавать этот анализ?
Исследование назначают детям, имеющим хотя бы один из перечисленных симптомов:
- к 12 месяцам жизни ребёнок ещё не лепечет и не жестикулирует (не машет рукой на прощанье, не указывает на предметы);
- к 16 месяцам — не выговаривает слова;
- к 24 месяцам — не произносит фразы из 2 слов (за исключением повторения одного и того же слова);
- у ребёнка любого возраста утрачивается какой-либо речевой или социальный навык.
Для проведения исследования нужно предоставить выписку из медицинской карты с информацией о диагнозе и ранее выполненных лабораторных (в том числе генетических) и инструментальных исследованиях.
Подробное описание исследования
Задержка психического развития
Задержка психического развития (ЗПР) — это целый комплекс неврологических нарушений, которые влияют на интеллект и поведение ребёнка.
Первые симптомы ЗПР обычно проявляются в возрасте до 2 лет — дети с таким диагнозом поздно начинают говорить (коверкают слова, используют ограниченный словарный запас), испытывают трудности с мелкой моторикой (им сложно удерживать предметы в руках, а движения пальцев неловкие и нескоординированные), не в состоянии самостоятельно одеться и использовать предметы быта. Игры у детей с ЗПР обычно очень примитивные (например, катание машинки из стороны в сторону), а поведение — часто плаксивое и раздражительное или, наоборот, нелюдимое, замкнутое.
Аутизм, или расстройство аутистического спектра
Аутизм, или расстройство аутистического спектра (РАС), — одна из причин задержки психического развития.
Как правило, первые симптомы аутизма возникают у детей в возрасте до 3 лет. Родители отмечают, что ребёнку тяжело даётся общение с другими людьми, он плохо контролирует свои эмоции, а в поведении могут появиться стереотипные движения, например раскачивание (стиминг).
«Красные флаги» аутизма у детей разного возраста
стремится упорядочить предметы (например, выстроить игрушки в ряд);
может подолгу беспорядочно размахивать руками, кружиться на одном месте или без остановки монотонным голосом задавать один и тот же вопрос
Не может самостоятельно составлять простые фразы;
стремится упорядочить предметы (например, выстроить игрушки в ряд);
может подолгу беспорядочно размахивать руками, кружиться на одном месте или без остановки монотонным голосом задавать один и тот же вопрос
По статистике, ЗПР и аутизм обнаруживаются примерно у 1% детей в мире. В большинстве случаев такие нарушения возникают из-за генетических поломок — мутаций в генах, которые отвечают за физическое и интеллектуальное развитие.
Панель «Задержка развития и аутизм»
Панель представляет собой исследование 286 генов, ассоциированных с задержкой психического развития (ЗПР) и расстройством аутистического спектра (РАС).
Панель выявляет:
- однонуклеотидные (SNV) и мультинуклеотидные (MNV) варианты в экзонах всех клинически значимых генов. Это точечные изменения в ДНК, при которых один или несколько соседних нуклеотидов (единиц генетического кода) заменяются на другие. Такие изменения способны приводить к нарушению функционирования белков и провоцировать заболевания, в том числе ЗПР и РАС;
- малые вставки и делеции (in/del) до 50 пар нуклеотидов в экзонах всех клинически значимых генов. Небольшие фрагменты ДНК, которые дублируются (вставки) или отсутствуют (делеции). Такие изменения нарушают структуру гена и могут приводить к патологическим состояниям;
- вариации числа копий генов (CNV), включая делеции/микроделеции и дупликации/микродупликации среднего и крупного размера (с ограничениями). Это крупные изменения в ДНК, при которых целые участки гена могут дублироваться (дупликации) или отсутствовать (делеции). Это может нарушать работу клеток и приводить к аутизму и ЗПР.
Исследование позволяет выявить гены, которые могли повлиять на развитие заболевания, и помогает точно установить диагноз и подобрать оптимальное лечение.
Преимущества метода
Метод NGS (секвенирование нового поколения) — наиболее современный метод генетического исследования. Он обеспечивает не менее 70 прочтений каждого участка генома, минимизируя влияние технических ошибок на результаты исследования. Благодаря этому удаётся с высокой точностью выявлять даже редкие или сложные мутации, а также оценивать их возможную связь с заболеванием. Метод позволяет анализировать большое количество генов одновременно, что особенно важно при наследственных заболеваниях, связанных с множественными мутациями в разных генах.
Ограничения метода
Метод NGS не выявляет варианты в генах с псевдогенами, паралогами и сегментарными повторами. Точность метода может снижаться в сложных участках генома (GC-богатые и poly-n участки). Вероятность обнаружения причины заболевания составляет от 20 до 45%.
Исследуемые гены и ассоциированные с ними заболевания
Гены, исследуемые в панели «Задержка развития и аутизм», можно разделить на несколько больших групп — в зависимости от заболеваний, которые могут спровоцировать задержку психического развития.
Мутации в этих генах способны привести к задержке умственного развития, аутизму и синдромам, связанным с задержкой психического развития.
- ADNP — синдром ADNP (аутизм, задержка психического развития, интеллектуальная недостаточность).
- AHDC1 — синдром AHDC1 (аутизм, гипотония, задержка психического развития).
- FGD1 — синдром Аарскога — Скотта.
- ARID1A, ARID1B, SMARCA4, SMARCB1, SRCAP — синдром Коффина — Сирис.
- AUTS2 — синдром AUTS2 (аутизм, задержка развития, микроцефалия).
- BDNF — кодирует нейротрофический фактор мозга. Задержка развития, нарушение пищевого поведения, ожирение.
- CASK — микроцефалия, интеллектуальная недостаточность (связанная с Х-хромосомой).
- CDKL5 — эпилепсия с ранним началом, интеллектуальная недостаточность.
- CHD8 — аутизм, макроцефалия (увеличенный размер головы), задержка развития.
- CNTNAP2 — аутизм, эпилепсия, синдром Ландау — Клеффнера (приобретённая эпилептическая афазия).
- CREBBP, EP300 — синдром Рубинштейна — Тейби.
- CUL4B — TARPG-синдром.
- CHD2, CACNG2, DEAF1, GABRA5, GABRG3, GRIK5, KPTN, SCN2A, SLC9A9, SYNGAP1, STAG1 — интеллектуальная недостаточность, аутизм, эпилепсия.
- EHMT1 — синдром Клейфена.
- FOXP1 — задержка речи, интеллектуальная недостаточность, аутизм.
- GRIN1, GRIN2B — нейроразвитие, эпилепсия, двигательные нарушения.
- KANSL1 — синдром Кулена де Фриза (задержка развития, эпилепсия, характерные черты лица).
- KIRREL3 — синдром KIRREL3 (задержка развития, интеллектуальная недостаточность, аутизм).
- MBD5 — синдром MBD5 (тяжёлая задержка развития, аутизм, эпилепсия).
- MEF2C — синдром MEF2C (тяжёлая задержка развития, эпилепсия).
- KIAA1033, NRXN1 — аутизм, шизофрения, задержка развития.
- PHF6 — синдром Бёрьесона — Форсмана — Лемана.
- PTEN — синдромы, связанные с гамартомами PTEN (синдром Коуден, синдром Банаяна — Райли — Рувалькабы).
- PURA — синдром PURA (задержка развития, гипотония, проблемы с кормлением).
- RAI1 — синдром Смит — Магенис.
- SCN1A — эпилепсия (в том числе синдром Драве).
- SETD5, SHANK2, SHANK3, HANK3 — интеллектуальная недостаточность, аутизм.
- SNRPN — синдром Прадера — Вилли.
- TCF4 — синдром Питта — Хопкинса.
- TTI2 — синдром TTI2 (задержка развития, микроцефалия).
- ZEB2 — синдром Моуат — Вильсона.
- AHI1, CNTRL — синдром Жубер.
- FMR1 — синдром ломкой Х-хромосомы.
- HOXA1 — синдром дефекта развития ствола головного мозга.
- RPS6KA3 — синдром Коффина — Лоури.
Гены, ассоциированные с эпилепсией и другими неврологическими расстройствами
- CACN 2 — эпилепсия (в основном идиопатическая генерализованная).
- GABRB3 — аутизм, синдром Ангельмана, эпилепсия: мутации могут вызывать различные типы эпилепсии.
- PCDH19 — эпилепсия у девочек.
- SCN1A, SCN2A — эпилепсия.
- SERPINI1 — дефицит альфа-1-антитрипсина.
Шизофрения — психическое заболевание, которое меняет мышление и поведение: могут развиться апатия и безынициативность, нарушения речи, галлюцинации и бред. Кроме того, возникают проблемы с памятью и концентрацией.
- PIEZO2 — дистальный артрогрипоз типа V.
- ROR2 — синдром Робинова.
- ATP7A — болезнь Менкеса.
- HSD17B10, RBM10, SOX3, WDR13 — X-сцепленная умственная отсталость.
Нейродегенеративные заболевания — большая группа болезней нервной системы, при которых происходит постепенное разрушение и гибель нервных клеток (нейронов).
- AIFM1 — X-сцепленная нейродегенерация.
- CCDC22 — X-сцепленная интеллектуальная недостаточность с остеопорозом.
- DYNC1H1 — спинальная мышечная атрофия, врождённые пороки развития мозга.
- PANK2 — нейродегенерация с накоплением железа в мозге.
- SLC16A2 — синдром Аллана — Герндона — Дадли.
- TUSC3 — интеллектуальная недостаточность с аутосомно-рецессивным типом наследования.
- HCCS — синдром микрофтальмии с линейными кожными дефектами.
Нарушения в работе генов, регулирующих передачу сигналов от одного нейрона к другому, могут привести к аутизму, умственной отсталости, эпилепсии и шизофрении.
- AP1S2, ARHGEF6, GDI1, OPHN1, SYP, GRIA3 — X-сцепленная умственная отсталость.
- NLGN3, NLGN4X — расстройства аутистического спектра.
- RELN — лиссэнцефалия, шизофрения, расстройства аутистического спектра.
- SHANK3 — синдром Фелан — Макдермид.
- SLC9A6 — синдром Кристиансона.
- KCNJ1 — синдром Барттера.
- GRIK2 — умственная отсталость, расстройства аутистического спектра, эпилепсия.
Гены, ответственные за обмен веществ (метаболические гены)
- ACSL4 — X-сцепленная умственная отсталость, иногда с дискератозом.
- MPP3 — нефролитиаз.
- PDE8B — гипотиреоз.
- BCKDK — недостаточность киназы дегидрогеназы альфа-кетокислот с разветвлённой цепью.
- DHCR7 — синдром Смита — Лемли — Опица.
- FTSJ1, TMLHE — X-сцепленная умственная отсталость.
- HPRT1 — синдром Лёша — Нихена.
- IDS — синдром Хантера (мукополисахаридоз II типа).
- MBTPS2 — X-сцепленная кератопатическая ихтиоз-хондродисплазия.
- NSDHL — синдром CHILD.
- OTC — дефицит орнитинтранскарбамилазы.
- PGAP1 — гиперфосфатазия с задержкой развития.
- PIGV — гипофосфатазия с умственной отсталостью.
- PORCN — синдром Гольца.
- SLC2A1 — синдром дефицита GLUT1.
- SMS — синдром Опица.
- TIMM8A — синдром «глухоты — дистонии».
- MAGT1 — X-сцепленная умственная отсталость с атаксией и гипомагниемией.
- NDUFA1 — синдром Лея.
Мутации в этих генах могут привести к нарушению развития мозга. Риск аутизма, задержки психического развития при этом многократно повышается.
- ATP2A2 — болезнь Дарье.
- NEXMIF — синдром Снайдера — Робинсона.
- SOX5 — нарушение развития скелета.
- CENPJ, CEP152, CEP63, NIN — первичная микроцефалия.
- HSPG2 — синдром Дайка — Давыдова — Массона.
- LINS1 — умственная отсталость с аутизмом.
- MID1, MID2 — синдром Опица.
- MYH3 — дистальный артрогрипоз типов I, IIB.
- NHS — синдром Нэнса — Хорана.
- SHROOM4 — идиопатический сколиоз.
- TBX1 — синдром Ди Джорджи.
- EPB41L1 — наследственный сфероцитоз.
Гены из этой группы регулируют деление клеток и предотвращают неконтролируемый рост опухолей. Их мутации могут приводить к образованию опухолей головного мозга, а также генетическим синдромам с эпилептическими приступами.
- ARID1A, SMARCA4 — синдром Коффина — Сирис.
- HRAS — синдром Костелло.
- SETBP1 — синдром Шаафа — Янга, атипичный хронический миелолейкоз.
- TP53 — синдром Ли — Фраумени.
- ZMYND11 — синдром Маккьюна — Олбрайта.
Гены, ответственные за исправление ошибок в ДНК
- SMC1B — первичная недостаточность яичников.
- FANCB, RBBP8 — анемия Фанкони.
- RAD21, SMC1A, SMC3 — синдром Коффина — Сирис.
Эти гены играют важную роль в развитии и функционировании нервной системы. Мутации в этих генах могут приводить к различным расстройствам, таким как умственная отсталость, аутизм и эпилепсия.
- SHANK2, SYNGAP1 — расстройства аутистического спектра, умственная отсталость.
- CRBN — интеллектуальная недостаточность, врождённые пороки развития конечностей.
Под эпигенетической регуляцией подразумевается способность включать и выключать отдельные гены без внесения изменений в ДНК. Доказано, что мутации в этих генах могут привести к нарушению развития нервной системы и, как следствие, к расстройствам аутистического спектра (РАС).
- KMT2D — синдром Кабуки.
- ATRX — синдром ATR-X (X-сцепленная умственная отсталость с альфа-талассемией).
Мутации в этих генах способны привести к аномалиям развития мозга.
- CCDC88C — аутосомно-рецессивная умственная отсталость.
- KIF1A — наследственная спастическая параплегия.
Поломки в генах приводят к тому, что сигналы между нервными клетками передаются неправильно. А это негативно влияет на психическое развитие и может привести к задержке развития и умственной отсталости.
- FBXO31 — психические расстройства, в том числе шизофрения, депрессия.
- PRKN — болезнь Паркинсона.
- UBR1 — синдром Йохансона — Близзарда.
Список исследуемых генов
ABCD1, ABL1, ACSL4, ADAT3, ADNP, ADSL, AFF2, AGTR2, AHDC1, AHI1, AIFM1, ANK3, ANKRD11, AP1S2, AP4E1, AP4M1, AP4S1, ARHGEF6, ARHGEF9, ARID1A, ARID1B, ARX, ASPM, ATP2A2, ATP6AP2, ATP7A, ATR, ATRX, AUTS2, BCKDK, BCOR, BDNF, BLM, BRAF, BRWD3, CACNA1C, CACNG2, CASK, CC2D1A, CCDC22, CCDC88C, CDH15, CDK16, CDKL5, CDKN1C, CENPJ, CEP152, CEP63, CHD2, CHD7, CHD8, CHEK2, CLCN4, CLCNKA, CLIC2, CNKSR2, CNTN4, CNTNAP2, CNTRL, CRADD, CRBN, CREBBP, CTCF, CTNNB1, CUL4B, DCX, DEAF1, DHCR7, DKC1, DKK1, DLG3, DMD, DNA2, DOCK8, DYNC1H1, DYRK1A, EHMT1, EIF2S3, ELK1, EN2, EP300, EPB41L1, ERCC6, ERCC8, FAAH2, FANCB, FBXO31, FGD1, FLNA, FMR1, FOLR1, FOXG1, FOXP1, FOXP2, FRMPD4, FTSJ1, GABRA5, GABRB3, GABRG3, GDI1, GK, GPC3, GRIA3, GRIK2, GRIK5, GRIN1, GRIN2B, GSPT2, HCCS, HCFC1, HDAC8, HERC2, HOXA1, HOXB1, HPRT1, HRAS, HSD17B10, HSPG2, HUWE1, IDS, IGBP1, IL1RAPL1, IQSEC2, KANSL1, KCNJ1, KDM5C, KIAA0196, KIAA1033, KIAA2022, KIF1A, KIF4A, KIRREL3, KLF8, KLHL3, KMT2D, KPTN, L1CAM, LAMB1, LAMC3, LAMP2, LIMK1, LINS1, MAD1L1, MAGI2, MAGT1, MAN1B1, MAOA, MAPK1, MBD5, MBTPS2, MCPH1, MECP2, MED12, MED23, MEF2C, MET, METTL2, METTL23, MID1, MID2, MPP3, MTM1, MYH3, NAA10, NDP, NDST1, NDUFA1, NEXMIF, NHS, NIN, NIPBL, NLGN3, NLGN4X, NRXN1, NSD1, NSDHL, NSUN2, NXF5, OCRL, OFD1, OPHN1, OTC, OXTR, PAFAH1B1, PAK3, PANK2, PCDH19, PCDH9, PDE8B, PDHA1, PGAP1, PGK1, PHF6, PHF8, PIEZO2, PIGV, PLAUR, PLP1, PNKP, PORCN, PQBP1, PRKN, PRPS1, PRSS12, PTCHD1, PTEN, PTPN11, PURA, RAB39B, RAD21, RAI1, RB1, RBBP8, RBFOX1, RBM10, RELN, RFWD2, RLIM, RNASE12, RORA, ROR2, RPL10, RPL15, RPS6KA3, SATB2, SCN1A, SCN2A, SERPINE1, SERPINI1, SETBP1, SETD5, SH3D19, SHANK2, SHANK3, SHROOM4, SLC16A2, SLC25A12, SLC2A1, SLC6A4, SLC6A8, SLC9A6, SLC9A9, SMARCA4, SMARCB1, SMC1A, SMC1B, SMC3, SMG6, SMS, SNRPN, SOX3, SOX5, SPAST, SPECC1L, SRCAP, SRGAP3, SRPX2, ST3GAL3, STAG1, STXBP1, SYN1, SYNGAP1, SYP, TBX1, TCF4, TECR, THOC2, TIMM8A, TMLHE, TP53, TRAPPC9, TSC1, TSC2, TSPAN7, TTI2, TUSC3, UBE2A, UBE3A, UBR1, USP9X, VPS13B, WDR13, WNT5A, ZEB2, ZMYND11, ZNF81.
Технология выполнения
Биоматериал
Вен. кровь
Подготовка к исследованию
Специальной подготовки не требуется.
Если пациент перенёс пересадку костного мозга, проходил лечение стволовыми клетками, а также если в течение последних 3 месяцев ему делали переливание крови, сообщите об этом при оформлении заказа.
Интерпретация результата и дальнейшие шаги
Результат исследования — заключение биоинформатика (клинического интерпретатора). В заключении предоставляется информация о выявленных патогенных и вероятно патогенных вариантах, которые могут иметь отношение к клинической картине, описанной в предоставленной медицинской документации.
Для целостной и объективной интерпретации результата исследования необходимо обратиться за консультацией к врачу-генетику.
Если в результате исследования были выявлены клинически значимые варианты, имеющие отношение к заболеванию, врач может назначить дополнительное обследование родителей или других родственников пациента.
Если клинически значимые варианты не были выявлены, но подозрение на генетическую природу заболевания осталось, врач может назначить дополнительные генетические исследования: полное секвенирование экзома или генома.