Ограничения ПЦР-анализа на мутации генов BRCA1 и BRCA2 в сравнении с анализом, выполненным методом секвенирования нового поколения (NGS)

Пациентка с диагнозом «рак молочной железы» (РМЖ) сдала в Лаборатории Гемотест анализ генов BRCA1 и BRCA2 методом ПЦР.

Это исследование, направленное на поиск восьми наиболее распространённых мутаций в генах BRCA1 и BRCA2, ассоциированных с наследственными формами рака молочной железы и яичников.

Перечень мутаций, включённых в исследование:

• BRCA1: 5382insC;
• BRCA1: 4153delA;
• BRCA1: 185delAG;
• BRCA1: 3819delGTAAA;
• BRCA1: 3875delGTCT;
• BRCA1: 300 T>G (Cys61Gly);
• BRCA1: 2080delA;
• BRCA2: 6174delT.

При диагностированном РМЖ анализ на мутации в генах BRCA1 и BRCA2 помогает врачу дать точный прогноз и выбрать тактику лечения. Так, при наличии генетических мутаций риск развития рака выше, поэтому носителю опасных мутаций может быть рекомендована двусторонняя мастэктомия. При отсутствии таких мутаций генетический риск развития рака контралатеральной молочной железы может быть оценён как низкий и является основанием для принятия решения о выполнении органосохраняющей операции с удалением только поражённой молочной железы.

Результат исследования показал отсутствие патогенных мутаций во всех восьми исследованных точках генома.

В результате расширенного исследования в гене BRCA1 была выявлена патогенная мутация, не входящая в панель из восьми мутаций, исследуемых методом ПЦР.

Получив новые данные, пациентка обратилась в Гемотест с вопросом о корректности результатов первоначального анализа. Специалисты лаборатории провели проверку качества выполнения ПЦР-анализа, которая подтвердила его корректность в пределах исследуемых параметров.

В ходе консультации эксперты разъяснили принципиальные различия между двумя методами исследования:

• ПЦР-анализ генов BRCA1 и BRCA2 позволяет выявить только восемь конкретных точечных мутаций, которые статистически встречаются наиболее часто в российской популяции. Этот метод высокоспецифичен для выявления именно этих мутаций, но не анализирует остальные участки генов.
• NGS-секвенирование представляет собой полногеномное исследование, анализирующее всю последовательность генов BRCA1 и BRCA2 (более 6 000 нуклеотидных позиций в каждом гене). Этот метод способен выявить любые мутации, включая редкие варианты, крупные делеции и дупликации.

Специалисты подчеркнули, что, хотя большинство случаев наследственного рака молочной железы и яичников действительно связаны с восемью мутациями, исследуемыми при ПЦР, в 10–15% случаев патогенные мутации могут локализоваться в других участках генов.

Выводы

ПЦР-анализ мутаций генов BRCA1 и BRCA2 является эффективным скрининговым методом для выявления наиболее частых патогенных вариантов, но не исключает редких мутаций в других участках генов. Пациентам с высоким клиническим подозрением на наследственный рак молочной железы, отягощённым семейным анамнезом или при ранней манифестации заболевания рекомендуется проведение полного секвенирования генов BRCA1 и BRCA2 методом NGS для исключения всех возможных патогенных вариантов.